중복 데이터를 확인한후 엑셀에서 지우시나요?
중복 데이터를 확인이 가능하다면?
중복 데이터를 삭제하는 방법이나
중복 데이터를 제외하고 1건만 조회하는 것도 가능할 것입니다.
삭제 또는 중복 제거하고 조회하는 Select 방법을 찾아보세요.
그런 뒤에 Insert Into ~ Select ~ 구문을 이용하시면 됩니다.

-- 임시테이블에서 중복제거한 목록을 바로 뽑아 입력하기 --
INSERT INTO 테이블1(partNum, description, newP_Num)
SELECT partNum, description, newP_Num
  FROM (SELECT no, partNum, description, newP_Num, cost
             , ROW_NUMBER() OVER(PARTITION BY partNum ORDER BY newP_Num, cost DESC, no) rn
          FROM CheckParts
        ) a
 WHERE rn = 1
;

INSERT INTO 테이블2(partNum, cost)
SELECT partNum, cost
  FROM (SELECT no, partNum, description, newP_Num, cost
             , ROW_NUMBER() OVER(PARTITION BY partNum ORDER BY newP_Num, cost DESC, no) rn
          FROM CheckParts
        ) a
 WHERE rn = 1
;

-- 임시테이블에서 중복 자료 삭제하기 --
DELETE FROM CheckParts
 WHERE no IN (SELECT no
                FROM (SELECT no
                           , ROW_NUMBER() OVER(PARTITION BY partNum ORDER BY newP_Num, cost DESC, no) rn
                        FROM CheckParts
                      ) a
               WHERE rn > 1
              )
;